停薪留职，最好与用人单位就社保缴费问题达成协议，以免影响相关社保待遇的享受。在停发工资期间，虽然劳动者与用人单位仍有劳动关系，但没有实际向用人单位提供劳务，不接受用人单位的日常管理，那么在此期间，用人单位一般没有义务为劳动者缴纳。《中华人民共和国社会保险法》第二条：国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。一、停薪留职期间有关问题的处理。1、工资待遇问题：在停薪留职期间停发工资、奖金和各种津贴、补贴（包括房贴）等，本人标准工资作为档案工资保留。2、劳保福利待遇问题：职工在停薪留职期间，不享受原单位的各种福利待遇、劳保津贴和劳动保护用品。