房屋土地使用发证机关是土地管理部门。办理土地使用证应由土地使用人携带土地使用权登记申请书、个人身份证明或者户籍证明、土地使用权来源证明向有关登记机关提出登记申请；土地管理机关勘查土地现场，进行权属审核；初审、公告、复审、批准登记后颁发土地使用权证书。【本文关联的相关法律依据】。《土地管理法实施条例》第三条。国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。土地登记内容和土地权属证书式样由土地行政主管部门统一规定。土地登记资料可以公开查询。《城市房地产管理法》第六十一条。以出让或者划拨方式取得土地使用权，应当向县级以上地方土地管理部门申请登记，经县级以上地方土地管理部门核实，由同级颁发土地使用权证书。