个人所得税申请退税的时间限制是在3月1日到6月30日期间进行汇算清缴。个人所得税退税的时间限制确实是在每年的3月1日至6月30日之间。在这个时间段内，纳税人需要完成年度的汇算清缴工作。如果在预缴税款过程中存在多缴的情况，或者有符合条件的专项附加扣除未能扣除，或者因为就业、退职等原因导致税收优惠政策变动，以及劳务报酬、稿酬等预扣预缴税率高于应纳税额的情况，纳税人都可以在规定时间内向税务机关提出退税申请。个人所得税退税申请的步骤。1.准备相关资料：包括身份证明、税务登记证、工资薪金收入证明、已缴税款凭证等。2.提交申请：向任职单位或扣缴义务人提出退税申请，并提供上述相关资料。3.单位或扣缴义务人审核：审核纳税人提供的信息和资料是否齐全、准确。