有的合伙合同纠纷涉及违法项目法院不会处理，合伙协议纠纷债务要清算，且有相关的流程如下：1、合伙清算的概念和清算人的确定。合伙合同终止后，须进行清算。合伙的清算是合伙解散，了结合伙法律关系，以消灭合伙的程序。根据《合伙法》第五十九条规定，合伙企业解散，清算人由全体合伙人担任；未能由全体合伙人担任清算人的，经全体合伙人过半数同意，可以自合伙企业解散后15日内指定一名或者数名合伙人，或者委托第三人，担任清算人；15日内未确定清算人的，合伙人或者其他利害关系人可以申请人民法院指定清算人。2、合伙清算的内容；