会处理的，但是需要当事人向法院递交起诉状。合伙协议纠纷，只是属于民事案件当中的一个案由，任何一个民事案件诉讼到法院，法院都要经过开庭审理，法官会根据双方提交的证据，以及案件的具体情况来进行判决。合伙协议纠纷只是一个案由，法院都是根据证据和案件事实来判决的，无法根据一个按由来判决。如果根据一个案由判决，那么同一个案由的案件就会出现同一个结果，对当事人是有失公平和公正的。所以说，如果诉讼之前，最好组织好相应的证据。对个人合伙关系的认定，法院注重审查各方是否存在合伙协议及协议约定的具体内容。不存在合伙协议或各方对协议成立、效力有较大争议的，则要注意审查双方在实际经营中是否存在利润分配方案、合伙事务管理方案及相应记录材料。一、出现合伙合同纠纷怎么赔偿损失。