运输企业印花税的计算方法。1、若货物运输企业采用核定征收方式缴纳货物运输合同的印花税，应当以按照企业会计制度确认的主营业务收入作为计税依据。2、若货物运输企业采用自行贴花方式缴纳货物运输合同的印花税，其开具的货运专用或普通属于应税凭证，应当以上列明的运输费用作为计税依据。货物运输印花税申报方式。1、贴花法，由纳税人根据税法规定，自行计算缴纳税额，并购买印花税票贴在应税凭证上。另外企业也可以预先购买印花税票，发生应税行为的时候，自行计算缴纳税额，将已购买的印花税票粘贴在应纳税凭证上，每枚税票的骑缝处要盖戳注销或者划销。2、汇总汇缴，这种方式适用一份应税凭证应纳税额超过500元的情况，又或者同一种类应纳税凭证，需频繁贴花的，可以向当地税务机关申请印花税汇总缴纳。