由于肝脏或肾脏移植患者的疾病非常严重，且经常是多药合用，与免疫抑制剂相关的副作用通常难以确定。有证据表明普乐可复的多种不良反应均为可逆性，减量可使其减轻或消失。与静脉给药相比，口服给药的副作用发生率较低。多数患者似乎在术后最初几周出现较多的不良反应，可能与高剂量静脉用药有关。普乐可复较常见的副作用有。震颤、头痛、感染、肾功能损害、高血压、高钙血症、高血糖和低磷血症。失眠、思维障碍、视力下降、便秘、腹泻和白细胞增多也多见。偶尔可有中枢神经系统和感觉异常（如抑郁、神经疾病、精神紧张、焦虑、肌张力增高、共济失调、情绪不稳、健忘和脑病）。呼吸系统疾病（呼吸困难、肺不张）、心血管疾病（心绞痛、心律失常、心包积液）和皮肤病变（脱发、瘙痒、出汗、皮疹、光过敏）。