有限公司申请破产，债务由破产财产承担，按优先顺序清偿。破产财产清偿顺序为：职工工资、社会保险费、税款、普通破产债权。破产财产不足时按比例分配。不属于破产财产的包括他人财产、抵押品、担保物、优先权财产等。法律分析；一、有限公司申请破产债务由谁来承担。1、有限公司申请破产后，公司的债务由公司破产财产承担，按一定的优先顺序清偿债务。2、《中华人民共和国企业破产法》。第一百零七条人民依照本法规定宣告债务人破产的，应当自裁定作出之日起五日内送达债务人和管理人，自裁定作出之日起十日内通知已知债权人，并予以公告。债务人被宣告破产后，债务人称为破产人，债务人财产称为破产财产，人民受理破产申请时对债务人享有的债权称为破产债权。第一百一十三条破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿。