年终奖单独申报操作流程如下：1、计算年终奖金：企业首先需要计算员工的年终奖金，确定应缴纳的个税金额。根据国家税务局规定，年终奖金的个税计算方式与月薪相同，但税率不同。2、申报个税：企业需要在国家税务局网站上下载个人所得税申报表，并填写相关信息，包括员工的个人信息、年终奖金金额、应缴纳的个税金额等。3、缴纳个税：企业在提交个人所得税申报表后，需要在规定时间内缴纳员工的个税。企业可以通过网银、银行转账等方式进行缴纳。年终奖单独申报需要的资料如下：1、个人身份证明：包括个人身份证、户口本、社保卡等身份证明资料。2、工资收入证明：包括个人所在企业的工资收入证明、个人所得税缴纳证明等。3、年终奖金收入证明：需要提供年终奖金的发放证明，包括企业的发放凭证、收据等。