有林权证的林地被征用怎么赔偿。1、用地单位再持以上审批文件，向原预审的国土资源局提出项目用地的正式申请。2、由国土资源局具体负责对该农用地的所有权人和使用权人进行征用，签订补偿安置协议，按征地程序办理征地手续。3、国土资源局根据批准的供地方案，在征地的补偿、安置补助完成后，向用地单位发出批准用地文件。一、办理林权证的程序有哪些。1、申请首先是由林权权利人对林地或林木的所有权、使用权或者说是林权变更、注销向所在地县级以上林业主管部门提出申请。填写《林权登记申请表》，并提供林权变更的相关材料及申请人身份证明材料。