人民重新计算补充侦查案件的审查起诉期限，补充侦查后仍认为证据不足的可不起诉，两次补充侦查后仍不足的必须不起诉。对已退回机关的案件，发现新犯罪事实需移送机关，已查清的犯罪事实需提起公诉。法律分析；1、退回补充侦查完毕移送人民后，人民重新计算审查起诉期限。2、对于补充侦查的案件，人民仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。也就是说，案件经过一次补充侦查，人民认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定；如果经过两次补充侦查，仍然证据不足，不符合起诉条件的人民应当作出不起诉决定。3、人民对已经退回机关二次补充侦查的案件，在审查起诉中又发现新的犯罪事实，应当移送机关立案侦查；对已经查清的犯罪事实，应当依法提起公诉。