超员是指车辆载客人数超过额定乘员百分之二十的情况。对于5座车超员2人的情况，机关交通管理部门将对驾驶人处以500元以上2000元以下罚款并扣六分，同时扣留车辆直至违法状态消除。法律分析；5座车超员2人属于超过额定乘员百分之二十的情形，会由机关交通管理部门对该机动车驾驶人处五百元以上二千元以下罚款扣六分，并由机关交通管理部门扣留该机动车至违法状态消除。拓展延伸；超员违规：5座车载客超员2人，违法行为将受到严厉惩罚。