工程项目审计的内容主要有：1、建设工程竣工结算的真实性、合规性；2、交付使用资产真实性、完整性。3、竣工财务决算报表和说明书完整性、真实性；4、建设工程竣工结算的真实性、合规性；5、概算执行情况；6、审查决算资料的完整性；7、竣工财务决算报表和说明书完整性、真实性；8、结余资金及基建收入；9、尾工工程。资料拓展；工程项目审计是对单项工程项目从投标中标、组织施工到竣工交付使用全过程的经济活动和管理活动所开展的审查监督活动，包括对工程项目的内容制度、财务收支、经济效益以及经济责任等内容进行审查。