两种发行制度的根本区别在于，注册制强调让市场决定股票的价值，行政干预应尽量减少，充分发挥市场优胜劣汰的机制和融资功能。而核准制要求监管机构提前对要求上市的企业进行价值判断，保证证券市场上均为优质上市公司，主要适用于准入和退出机制不健全、发展尚未规范的证券市场。而我国证券市场则处于制度尚未完善，却需要充分发挥融资功能的阶段。十一五”期间，我国将通过完善市场的基础性问题来实现资本市场的飞跃。数据显示：2005年中国资本市场融资功能基本萎缩，银行贷款占到企业融资的90%以上。这不仅加剧了银行业的风险，也使证券市场边缘化的问题更加严重。因此，改革证券发行制度，扩大直接融资比重已成当务之急。