法律分析：1、发放年终奖的当月工资高于5000元时，年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。2、当月工资低于5000元时，年终奖个人所得税=(年终奖-(5000-月工资))*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(5000-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。法律依据。《关于工资总额组成的规定》第四条中规定，工资总额中包含奖金，《关于工资总额组成的规定若干具体范围的解释》第二条明确规定，年终奖属于奖金范围。因此年终奖应纳入工资总额范围，性质上属于工资。但年终奖的发放，劳动法律没有硬性的规定，是否发放年终奖，属于单位的自主权利，但如果劳动合同中有明确约定，或者单位的规章制度中对年终奖有明确规定，单位就应该按照约定或规定发放。