1、含义不同：自然人独资，标准称呼是一人有限公司，它由《公司法》规定，原则上与一般有限责任公司一样，只承担有限责任，股东与公司相分离。是能独自承担民事责任的个人。个人独资企业，是一类特殊的企业，个人独资企业，简称独资企业，是指由一个自然人投资，全部资产为投资人所有的营利性经济组织。它由《个人独资企业法》来规定，投资人承担无限责任，与个体工商户非常相像，但与个体户，它可以有自己的名字、招牌等。2、承担责任不同：如果破产时所欠的钱高于公司自身的资产，无力偿还，个人独资企业的投资人必须承担连带的偿还责任。而有限公司，包括一人有限公司，则把公司赔完就完，投资人没有责任。《公司法》第63条规定，一人有限责任公司的股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产的，应当对公司债务承担连带责任。