企业合并可以以下方式维护职工利益：首先给予员工自由选择的机会，即职工有权自由选择去留。若职工选择离开，则企业需要对职工进行相应补偿。一般是按劳动者在本单位工作的年限决定经济补偿的数额，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿；六个月以上不满一年的，按一年计算。二、拆迁企业员工赔偿标准。拆迁员工的补偿标准如下：1、对员工补贴，按补偿按员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付，六个月以上不满一年的，按一年计算，不满六个月的，向员工支付按半个月工资计算。