新农合和居民医保是两种不同的医疗保险制度。它们的区别主要有以下几点1. 覆盖人群不同：新农合是针对农村户口的买，而居民医保是针对非农业户口的买。2. 报销比例和起付线不同：新农合在乡镇卫生院报销比例高，起付线低，而在城市医院报销比例相对较少；居民医保起付线略高于新农合，大医院报销比例略高，但交的保费也多一些。3. 管理部门不同：城镇居民医疗保险主要由人力资源和社会保障部门管理，而新农合大部分地方由卫生部门管理。4. 报销的医疗目录不同：新农合可报销的医药目录比城镇医保少，乡镇卫生院新农合报销比例较高，市级医院平均报销比例比城镇医保低1.20%，最高限额也低于城镇医保。