经过鉴定伤残等级之后，根据农民工丧失劳动能力程度或者伤残等级，按照受诉所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准赔偿。赔偿单位一般应由工伤保险基金依法赔偿给劳动者其治疗工伤的医疗费用和康复费用、住院伙食补助费、伤残辅助器具费等费用；而用人单位则应依法赔偿给劳动者其治疗工伤期间的工资福利；终止或者解除劳动合同时的一次性伤残就业补助金等费用。农民工申请工伤认定的程序如下：1、用人单位向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。2、提交相关材料。3、社会保险行政部门对事故伤害进行调查核实。4、作出工伤认定的决定并书面通知申请工伤认定的职工或者其近亲属和该职工所在单位。【本文所涉及的法律依据】：。《工伤保险条例》；第三十条；