新农合办理住院流程如下：1、住院：当农民因疾病住院时，应该尽快通知所在的新农合经办机构或者村委会等相关部门。2、报销申请：住院期间，农民需要向医院索取相关收费和住院证明等材料，并在出院前向所在的新农合经办机构提交报销申请。申请时需要提供病历、住院证明、费用清单等相关资料。3、审核：新农合经办机构会对农民提交的报销申请进行审核，核实费用清单和住院证明等材料的真实性和合法性。若审核通过，则可进行费用报销。4、报销：经审核通过后，新农合经办机构会将符合报销要求的费用转入农民的个人账户中，农民可凭转账记录或者相关证明材料向医院结算。新农合办理住院材料。1、新农合医疗保险证：需要提供新农合医疗保险证原件及复印件。2、身份证/户口本：需要提供住院患者的身份证或户口本原件及复印件。