迟到两小时扣一天工资不合法。劳动者迟到，用人单位扣一天工资的规定是不具有法律效力的，用人单位的行为属于一种无故克扣工资的行为，劳动者可以向当地的劳动监察部门进行投诉举报或者申请劳动仲裁。扣工资的条件具体如下：1、职工因个人主观原因没有完成生产任务，并非身体问题等所致，单位可扣减其工资。扣后工资不能低于本市最低工资标准。2、职工违反劳动纪律，并造成单位损失时。单位因此扣减工资，每月扣减比例必须小于该职工月工资的20%；/3、职工请事假/4、按照缺勤一天扣一天的工资计算。5、职工请病假，按照病假工资发放，可以扣减其绩效或生产性奖励等。