法律分析：劳动纠纷立案对企业没有影响。劳动仲裁是解决公司与员工之间发生劳动争议的合法途径。劳动仲裁裁决结果并不属于行政处罚行为，劳动仲裁案件本身的客观存在并不会影响公司的运行。发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，可以向人民起诉。劳动纠纷立案的流程具体如下：1、带着仲裁裁决书、起诉书到基层立案庭立案，提交相关证据。2、开庭后，先由原告陈述，再由被告陈述，然后交换证据，接下来就是法庭辩论。3、最后，法官调解，调解不成，法官会出判决书。法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》。