法律分析：个人所得税手续费退税具体流程如下所示。1、首先，打开自然人电子税务局（扣缴端）（以下简称扣缴端），登录扣缴端。2、在登录进入扣缴端界面以后，点击“代扣代缴”子目录下进入系统的【退付手续费核对】功能。3、点击【获取结报单】，等待系统自动查询出退付手续费信息后核对所属期、数据是否准确。4、核对无误之后，点击“我已核对无误”按钮提交。5、点击“我已核对无误”后系统弹出“代扣代缴手续费退费申请”，选择“开户银行”、“银行账号”，“开户银行网点”自动带出。阅读声明后，点击“提交”。提示信息“确认成功”弹框，点击“确定”。6、填报完成后系统将推送至税务机关审核，等待审核完成后，即可返还对应的手续费。法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》。