补偿协议有法律效力。只要各方当事人认可协议内容、自愿签署，就具有法律效力。私人之间签署各种协议，这在现实生活中非常多见。除了用于违法犯罪的协议不受法律保护之外，其他正当合理协议均受法律保护。只要达成了赔偿协议并由协议各方签字或盖章且不违反法律的强制性规章，就具有法律效力了。协议生效后，一方不履行协议，守约方可以向人民起诉要求违约方履行协议义务，并给付违约金。协议书是双方在平等自愿基础上签订，是双方真实的意思表示。立约双方有符合法律规章的立约能力，约定标的不违反国家强制性法律行规等规章，约定条款不违反国家法律行规规章，没有欺诈胁迫情形，合同条款没有对一方不公平，经过了双方签字盖章。这样的协议有法律效力。赔偿协议的注意事项。一、赔偿项目不明确。二、表达意思模糊。