分公司注销应当在工商登记机关备案。需要提交营业执照、总公司撤销分公司的决议等资料。分公司注销之前不需要进行清算，因为分公司的债务由总公司承担。一、有限公司申请破产分公司怎么办。公司破产注销后，其分公司也随之注销。分公司在法律上、经济上没有性，不具有企业法人资格，没有自己的名称、章程，没有自己的财产，分公司的所有资产全部属于总公司。实际占有和使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中。并以总公司的资产对分公司的债务承担法律责任。分公司不承担民事责任，没有董事会等形式的公司经营决策和业务执行机关，总公司要对分公司的债务负无限责任。综上，分公司依附于总公司而存在，总公司注销后，为分公司承担民事责任的主体消亡，分公司也要注销。二、分公司可以投资入股吗。