法律分析：合并公司与收购公司的主要区别是。1、主体不同，合并主体是公司，收购主体是收购公司和目标公司的股东。2、效果不同，合并的后果是公司实体的变化，收购的后果是目标公司控股股东的变化。3、性质不同，合并是双方协商合作的结果，收购包括要约收购。4、程序和法律适用不同。合并遵守《中华人民共和国公司法》，收购遵守《中华人民共和国证券法》。法律依据：《中华人民共和国公司法》。第一百七十三条 公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日.内，未接到通知书的自公告之.日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。