发生医疗事故该采取以下方式处理：1、发生医疗事故的，医疗机构应当按照规定向所在地卫生行政部门报告；2、当事人可以协商解决或者向卫生行政部门提出调解申请。3、符合起诉条件的，可以向人民提起民事诉讼。法律依据：《医疗事故处理条例》第三条处理医疗事故，应当遵循公开、公平、公正、及时、便民的原则，坚持实事求是的科学态度，做到事实清楚、定性准确、责任明确、处理恰当。第四十六条发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民提起民事诉讼。第四十七条双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书