迟到属于违反劳动纪律，用人单位可依规章制度对此进行处罚，但需合法制定。公司对员工违规行为可扣除工资，但最高不超过当月工资的20%，且不得低于最低工资标准。罚款需有法定依据，公司没有罚款权限，只能扣除工资。法律分析；劳动者迟到属于违反劳动纪律，用人单位应当有权在规章制度或企业奖惩制度中，对此类行为进行一定的处罚，以实现双方的权利义务平等。公司依法有权对员工的违规行为作出处罚，但前提是公司有处罚依据，并且是合法制定的。因此，罚款是否合法，一看公司是否有相关规章制度规定；二看规章制度是否合法。如果公司没有相关规章制度规定，作出处罚是没有依据的，是违法的。