迟到工资扣除一般没有标准。1、员工迟到扣工资的标准一般与公司的员工管理章程有关的，不同的公司，处罚力度都是不一样的。2、因此需要结合劳动者所在的公司员工管理章程确定迟到扣工资的标准。员工上班迟到被扣工资不合法，但是因劳动者的原因造成公司损失可扣除工资，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。一、如果员工想辞职，提前30天，工资不发。员工未提前通知公司离职，公司扣工资或不发工资是不合法的。但是，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的百分之二十。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。二、公司克扣工资怎么办。