员工生病后不能继续工作公司处理如下：1、如果职工生病公司解除劳动合同是属于违法解除劳动关系，用人单位需要向劳动者支付违法解除劳动关系的赔偿金。2、按照没坐满一年支付2个月工资的标准支付，还需要支付未提前一个月通知的代通知金。员工生病后不能继续工作企业禁止解除劳动合同的情形如下：1、从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人 在诊断或者医学观察期间的。2、在本单位患职业病或者因工负伤并被确 认丧失或者部分丧失劳动能力的。3、患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的。4、女职工在孕期、产期、哺乳期的。5、在本单位连续工作满15年，且距法定 退休年龄不足5年的。6、法律、行规规定的其他情形。法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第四十条。