补偿协议书应包括以下内容。1、补偿协议应约定补偿方式，明确是货币补偿还是产权置换。2、被征收人选择货币补偿的，应当明确货币补偿金额和支付期限。3、被征收人选择产权交换的，应当明确产权交换房屋的位置和面积，被征收房屋与产权交换房屋之间的差价结算。4、搬迁费、临时安置费或周转房屋约定。5、被征收房屋为经营性房屋的，应当约定停产损失。6、对搬迁期限、过渡期限、过渡期限、纠纷解决方式等作出约定。【本文关联的相关法律依据】。《中华人民共和国民法典》。第四百七十条 合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款。（一）当事人的姓名或者名称和住所。（二）标的。（三）数量。（四）质量。（五）价款或者报酬。（六）履行期限、地点和方式。（七）违约责任。（八）解决争议的方法。当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。