公司账户被冻结的主要原因：1、冻结（民事诉讼中，依法裁定冻结）；2、或司法机构冻结（单位涉嫌犯罪）。3、公司与银行存在财务纠纷（银行向申请冻结）。冻结后，资金只能进账不能出账，需等待解冻。法律分析；公司账户被冻结的原因。1、冻结(民事诉讼中，依法地方裁定冻结)。2、相关机构或司法机关的冻结(单位因涉嫌犯罪)。3、公司存在和银行的财务纠纷(银行向申请冻结)。公司账户冻结一般是要经过的保全手续才能冻结公司账户，冻结后钱是只能进不能出，除非给解冻。拓展延伸；公司账户冻结后如何恢复正常使用。