法律分析。保险公司是否有权拒绝理赔脑干疾病，取决于保险合同中的具体条款。如果保险合同中没有将脑干疾病列为免除赔偿的范围，保险公司拒赔的行为是违约，不合法。法律依据。1.《保险法》第四十二条：保险人不得以虚假理由拒绝承担保险责任，不得无故拖延承担保险责任。2.《合同法》第十五条：保险合同应当明确保险标的、保险事故范围、保险期间、保险费、保险金及其给付方式等内容。3.《保险条款》第十二条：除本条款另有约定外，本保险条款所称“疾病”均指在本保险合同有效期内首次发生的、经诊断属于本保险条款所列明的疾病。综上所述，保险公司拒赔脑干疾病的理由是否合理，需要根据保险合同的具体条款加以判断。如果保险合同中未列明脑干疾病为免赔范围，保险公司的行为是违约的，投保人有权要求保险公司承担赔偿责任。