用人单位劳动合同丢失员工不愿意补签，用人单位可以和劳动者协商解除劳动关系，依法结清劳动者的合法工资，支付劳动者经济补偿金。《劳动合同法》第五十条规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。一、解除劳动合同得赔偿标准。《劳动合同法》第三十六条用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。第四十六条有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。(一)劳动者依照本法第三十规定解除劳动合同的。