两人打架住院的处理方式：首先可以由机关调解处理；情节较轻的，调解达成协议的，不予处罚；调解未达成协议或者达成协议后不履行的，机关应当依照本法的规定对违反治安管理行为人给予处罚。如果构成刑事犯罪的，机关应当立案侦查。一、派出所写的保证书录入档案吗。派出所写的保证书不会录入档案。对于因民间纠纷引起的打架斗殴或者损毁他人财物等违反治安管理行为，情节较轻的，机关可以调解处理。经机关调解，当事人达成协议的，不予处罚。经调解未达成协议或者达成协议后不履行的，机关应当依照本法的规定对违反治安管理行为人给予处罚，并告知当事人可以就民事争议依法向人民提起民事诉讼。二、派出所来调解后还会拘留吗。