企业个人所得税申报操作流程如下：1、输入客户名称，密码登录到个人所得税申报平台。2、点击人员信息采集，点击添加后，进入人员信息填写状态，输入名称，身份证号码，手机号码等带星符号的部分，填写完整保存，身份证信息会从待认证变为认证成功，直接进行报送，获取反馈即可。3、填写扣缴所得税报告表，月工资填写正常工资薪金报表。4、进入扣缴所得税报告表明细，填写人员工资收入，扣缴的五险一金社保款等，填写完毕后，会出现个人应缴税额，点击保存，最后点击申报报送，获取反馈。5、最后，如果有税额需要交纳，则直接点击税款缴纳即可，缴纳税款之后，会提示申报成功，缴款成功，如果没有税额的话，则会提示申报成功，无税额抵扣。