对房屋用地纠纷的解决办法，主要有三种。1、协商解决。2、行政解决。3、司法解决。4、房屋用地纠纷还可以通过人民调解来解决。【本文关联的相关法律依据】。《中华人民共和国土地管理法》第十四条土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。