夫妻分居两年不会自动离婚，只能通过协议离婚或诉讼离婚。协议离婚需签订书面协议并办理离婚登记，而诉讼离婚需提供感情破裂证据并向法院起诉。分居二年可作为法院判决离婚的依据。无论分居多久，婚姻关系不会自动解除。法律分析；分居证明没有专门的开具机构。通常，双方可以签署分居协议，或者由居委会或物业出具证明。双方可拟一份因感情不合而分居的协议，一般分居二年可作为法院判决离婚的依据。注意的是只要是合法婚姻关系不管分居多久都不能自动离婚。一、夫妻分居两年算离婚吗。夫妻分居两年不算离婚的。我国法律并没有规定自动离婚的情形。离婚只能协议离婚或者是诉讼离婚。协议离婚的，双方去民政局办理离婚登记即可。诉讼离婚的，去当地的法院起诉离婚即可。因感情不合分居满二年经法院调解无效的，法院会判决准予离婚。