重大飞行事故罪追诉时效是两年，刑事案件是有追诉期限的，过了规定的追诉时效后，犯罪分子便不会被公诉机关提起公诉，人们再也不能够将犯罪分子给捉拿归案了。根据《中华人民共和国刑法》第八十七条犯罪经过下列期限不再追诉。(一)法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年。(二)法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年。(三)法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年。(四)法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民核准。在人民、机关、机关立案侦查或者人民受理案件以后逃避侦查或者审判的，不受追诉时效期限的，被害人在追诉期限内提出控告，人民、人民、机关应当立案而不予立案的，不受追诉期限的。