一、公司清算程序终结怎么认定。1、债权人在规定的期限内未申报债权，在公司清算程序终结前补充申报的，清算组应予登记。公司清算程序终结，是指清算报告经股东会、股东大会或者人民确认完毕。2、法律依据：《关于适用中华人民共和国公司法若干问题的规定(二)》第十三条。二、有限公司清算程序是怎样的。有限责任公司的清算经过下列程序。1、成立清算组。2、登记债权。债权人申报期债券，应当说明债券的有关事项，并提供证明材料。清算组应当对债权进行登记。3、通知或公告债权人，清算组应当在成立之日起10日内通知债权人，并于60日内在报纸上至少公告3次。4、确定并实施清算方案。清算组制定的清算方案，应报股东会或有关主管机关确认。确认后，清算组即可按清算方案执行。