公司清算方案的确定有两种情况：1、公司自行清算的，由股东会或者股东大会决议确认2、人民组织清算的，由确认。只有经过确认的清算方案清算组才能执行。申请公司清算的流程：一、公司解散的决议须由公司股东会作出，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。二、股东会作出公司解散决议后15日成立清算组。清算开始之日(决议解散之日)起十日内，书面通知登记机关、税务部门、劳动部门及开户银行。三、到工商行政管理局领取《清算指南》、《清算报告书写格式》、《清算备案申请书》等表格，办理清算组备案。四、在工商局认可的报刊上刊登清算公告。首先，清算组应当自成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内在报纸上至少公告三次。债权人申报其债权，应当说明债权的有关事项，并提供证明材料。清算组应当对债权进行登记。