农村宅基地办不动产证没有什么坏处。如果不办不动产权证的，可能会有以下坏处。1、房屋不便于抵押贷款：农村的房子如果证件齐全，尤其是房子的房产证，就可以进行银行贷款。2、房屋不利于领取拆迁补偿：虽然在征收农村的土地时，都会基于农民相应的补贴。但如果你的房子有房产证，那么除了宅基地的补偿，还可以得到属于房屋的补偿费用。3、可能遭遇房屋纠纷：房产证不仅可以证明房子的归属，同时还清晰地记录了房子的面积、边界，这样可以有效避免农村潜在的房屋纠纷。