机关的立案程序是。1、立案、侦查和提起公诉。2、讯问犯罪嫌疑人、询问证人。3、勘验、检查、搜查。4、法庭辩论和最后陈述。5、评议、判决、宣告判决。法律依据。《中华人民共和国刑事诉讼法》。第一百八十六条 人民对提起公诉的案件进行审查后，对于起诉书中有明确的指控犯罪事实的，应当决定开庭审判。第一百九十六条 法庭审理过程中，合议庭对证据有疑问的，可以宣布休庭，对证据进行调查核实。人民调查核实证据，可以进行勘验、检查、查封、扣押、鉴定和查询、冻结。