单位开除员工的程序包括通知解除劳动合同、通知工会、出具解除合同证明、办理档案和社保转移手续、工作交接和支付经济补偿。根据《劳动合同法》第五十条，单位需在解除合同时出具证明，并在十五日内办理档案和社保转移手续。劳动者需按约定办理工作交接。单位应在办结工作交接时支付经济补偿。单位需至少保存已解除合同的文本两年备查。法律分析；单位开除员工的程序。1、通知劳动者解除劳动合同。2、将解除劳动合同理由通知工会。3、出具解除劳动合同证明。4、办理档案和社会保险关系转移手续。5、办理工作交接，支付经济补偿。《劳动合同法》第五十条规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。