员工违反保密协议可能承担民事、行政和刑事责任。民事责任包括赔偿公司损失；行政责任可处以罚款并要求返还或销毁涉及商业秘密的资料；刑事责任涉及侵犯商业秘密罪。法律分析；若员工违反保密协议，可能要承担以下法律责任。1、民事责任，公司可以要求员工赔偿因违约或侵权给公司造成的损失。2、行政责任，根据《反不正当竞争法》的规定，工商行政管理机关有权依法责令停止违法行为，并可以根据情节处以一万元以上，二十万元以下的罚款。同时工商管理机关还可以责令侵权人将载有商业秘密的图纸、软件及其他有关资料返还权利人或销毁。3、刑事责任。对于违反保密协议造成严重后果的当事人，我国刑法规定了侵犯商业秘密罪。拓展延伸；保密违法行为的法律后果及应对措施。