法律分析：一、公司内部惩罚员工工资违法吗。公司内部惩罚员工工资违法。单位罚员工的钱不合法，这种行为属于克扣工资，如果被罚款的，劳动者可以向劳动保障监察部门投诉，劳动保障行政部门会责令用人单位责令限期支付克扣的工资，限期不支付的，加付赔偿金。二、行政罚款和罚金的区别有哪些。罚款和罚金都是国家机关强制违法行为者在一定期限内向国家缴纳一定数量现金的处罚方法，但两者存在以下区别。1、法律性质不同。罚款属于行政处罚，而罚金则属于刑事处罚。2、执法机关不同。罚款一般由行政执法机关决定，而罚金则由人民依法判决。3、适用对象不同。罚款适用于违反行律、法规尚未构成犯罪的一般违法分子，而罚金则适用于违反刑事法律的犯罪分子。三、员工旷工怎么扣工资。