债务人跑了担保人该怎么办，分两种情况。（一）如果债权人在债务到期之日起6个月内，向人民起诉了，诉讼时效中断，担保人必须代替债务人偿还本金及合法利息，高息部分可以免除，然后向债务人追偿。（二）如果债权人在债务到期之日起6个月内没有向担保人催讨借款本金及利息，也没有向人民起诉，担保人的保证责任就免除了，不要再负担保责任，不必代替偿还债务。《民法典》第三百八十六条担保物权人在债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现担保物权的情形，依法享有就担保财产优先受偿的权利，但是法律另有规定的除外。第三百八十七条债权人在借贷、买卖等民事活动中，为保障实现其债权，需要担保的，可以依照本法和其他法律的规定设立担保物权。