法律分析：一、离婚程序不同。民政局协议离婚优点是比较方便，只要双方达成一致意见即可随时领取离婚证。而在达成调解协议则程序较繁琐，需先立案后开庭再判决。二、经济成本不同。民政局协议离婚经济成本低，而调解离婚，无夫妻共同财产分割的，五十元；涉及财产分割的，需按照财产标的收费。三、协议履行不同。从协议的履行方面来看，民政局协议离婚所备案的离婚协议书虽然有效，但是不具有强制执行的效力，当一方不履行协议内容时，另一方必须向另行起诉解决，而协议书中所约定的内容，并不是百分之百得到法律的支持。一旦产生纠纷，仍需判决，具有很大的不确定性。通过达成的调解协议离婚，有下达的调解书，具有可强制执行的效力。