用人单位若要合法的辞退不能胜任工作的员工，需要遵循以下条件和流程：（1）有证据证明劳动者不胜任工作，不胜任工作，是以员工的工作表现作为基础的判定，所以用人单位要注意平时对员工的工作表现进行事实固定。（2）用人单位对劳动者调岗或培训，法律要求用人单位完成一个过渡环节，即调整工作岗位或安排培训。（3）再次考核，劳动者仍不胜任工作。（4）经过工会程序：根据《劳动合同法》第四十三条的规定，用人单位应当在解除劳动合同前，将解雇理由通知工会。用人单位应当研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。（5）提前通知或支付代通知金，并支付经济补偿金。公司以不能胜任工作为由辞退员工怎么办。