特殊病种报销比例需视情况而定。1、如果在一级医疗机构进行住院治疗，报销比例为90%。2、二级医疗机构的报销比例为80%。3、三级医疗机构的报销比例在60%左右。医保指社会医疗保险。社会医疗保险是国家和社会根据一定的法律法规，为向保障范围内的劳动者提供患病时基本医疗需求保障而建立的社会保险制度。按照规定，基本医疗保险不予支付费用的诊疗项目共五类。1、服务项目类：部分医事服务费、院外会诊费、病历工本费等；出诊费、检查治疗加急费、点名手术附加费、点名手术附加费、优质优价费、自请特别护士等特需医疗服务。2、非疾病治疗项目类：具体见下面的解析。